Beschreibung GENOM 2005:
Genom 2005 ist ein komplexes, aber dennoch leicht zu bedienendes Programm zur Analyse von Microarray-Genexpressionsexperimenten (Affymetrix bzw. Ähnliche Technologien). GENOM 2005 beinhaltet die Analyse sämtlicher Arrays der Firma Affymetrix (cDNA-Arrays oder ähnliche Technologien sind auf Kundenwunsch integrierbar), Normalisierung und Migration der Rohdaten, Bereitstellung von Zusatzinformationen (offizielle Genbezeichnung und Synonyme, Genbeschreibung, Gensequenz, Chromosomenposition, Funktionsvorhersage, Referenznummern (Gene-Ontology, InterPro, SwissPROT ,EMBL, ENSEMBL, LocusLink, OMIM, GeneBank uvm.), Analysemethoden (Cluster-Verfahren, Support-Vector-Maschine, statistische Auswertung), Einordnung in metabolische und regulatorische Pfade (BioCarta, GenMAPP usw.), Integrierter Pathwayeditor, Funktionsvorhersage, Sequenzanalyse und viele andere Funktionen.
Englische Beschreibung von GENOM 2005:
Genom 2005 is a feature rich and user friendly application for analysing array-experiments (e.g. from provider Affymetrix). It includes normalisation of raw data, additional gene information official gene names, location, function prediction, sequences, database references (GeneOntology, InterPro, SwissPROT ,ENSEMBL, GeneBank...), multiple analysis methods (cluster, Support-Vector-Machine, statistical methods), automatic pathway mapping (BioCarta, GenMAPP...), an integrated pathway editor (user friendly drag and drop operation), function prediction, Sequence analysis and many things more.
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